微波在制药行业主要用于中草药材、药丸（水丸、水蜜丸、）药粉、药粒、药片、各种口服液的干燥、杀菌、加热、萃取。

    长期以来，我国医药加工业都是采用传统的加热干燥、杀菌方式，如采用热风、远红外进行药品的干燥．用高温高压，钴60辐照等进行杀菌。它们不仅热效率低、加热时间长、占地面积大．不利于环保，同时，杀菌要在120℃左右的高温下．时间20~40分钟．其药品的药效和营养成份受到一定程度的玻坏。而采用微波干燥、杀菌能充分发挥微波干燥、杀菌特性，就可以解决传统加热的弊端。例如：用精心设计的药丸微波干燥、杀菌设备，加工的药丸不龟裂，一致性好．保持原药性，大大延长了保质期