冷库要想取得满意的贮藏效果，单纯靠硬件设备是不行的。还应加强贮藏前、中、后期的管理。在整个贮藏期间做好以下几方面的管理：
①抓好原料的选择，保证产品的原始质量，用于气调贮藏对新鲜果蔬要求很高，如果原料本身已经发病或者成熟度很高，无论怎么高级的贮藏方式都不可能获得满意的贮藏效果。
②产品入库和出库时要尽可能做到按品种、成熟度、产地、贮藏时间要求等分库贮藏，不要混贮，入库时，除留出必要的通风、检查通道外，尽量减少气调间的自由空间。这样可以加快气调速度，缩短气调的时间，使果蔬尽早进人气调贮藏状态。
③果蔬预冷和空库降温，入库前先进行空库降温，可预先将围护结构的蓄热排除。气调贮藏的新鲜产品采收后应立即预冷，加速果蔬田间热的散发并尽快降低果蔬温度及呼吸热的产生。在气调间进行空库降温和入库后的预冷降温时，注意保持库内外的压力平衡，不能封库降温，只能关门降温。尤其是入库后的降温，一定要等果蔬温度和库温达到并基本稳定在贮藏温度时才能封库，在降温时就急于封库，会在围护结构两侧产生压差，对结构安全造成威胁。
④库房内应保持较高的相对湿度，有利于产品新鲜状态的保持。
⑤气体调节，当库内温度基本稳定后，应速封库，进行调气作业。
⑥注意安全性检查，果蔬从入库到出库，做好整个贮藏期果蔬的质量监测，每间气调库都应有样品果疏箱，放在库门或技术走廊观察窗门能看见和伸手可拿的地方，一般半个月抽样检查一次，包括硬度、糖分、含水量、形态等主要指标。特别指出，整个贮期严格监视果蔬的冻、病害的发生。
另外，气调贮藏要求速进速出。不能像普通果蔬冷库那样随便进出货，库外空气随意进入气调间，这样不仅破坏了气调贮藏状态，而且加快了气调门的磨损，影响气密性。因此，果蔬出库时，在短期内分批出完。
气调库及设备经一个贮季后，须进行年检，详细检修库房的气密性。气密破损的部位在修复后应重新进行气密性试验。各种机器设备、管道阀门、控制仪器仪表、电气部件等进行检查。
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